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谈到新“内阁”人选，陈诚表示，“本人将遵总统训示，为施政最高之原则，本此原则选贤与能”《中央日报》，1950年3月9日……随后，陈诚赴草山蒋介石住所，请示“行政院”各部会首长人选问题。
3月10日，蒋介石下达“总统令”，解散“阎锡山内阁”，任命陈诚为“行政院长”。同一天及次日下午，蒋介石连续主持召开国民党高层会议，讨论陈诚所提“内阁”人选问题。陈诚“组阁”也是困难重重，吴国桢开始坚持不合作态度，蒋介石再三规劝，有意让其担任“副院长”兼任台湾省政府主席，但吴“坚执不允”《蒋介石日记》（手稿本），1950年3月4日……蒋又邀吴国桢夫妇聚餐，宋美龄也利用与吴的关系来调解，“劝告其强勉忍耐，与陈合作”。陈立夫、王世杰等人都希望在“内阁”中有自己的位置。这使蒋在用人方面非常头痛，花很多时间“煞费苦心”，而且用人与不用人“不能明示理由，只有受人不谅之苦心而已”。﹏﹏a.
3月11日，他与陈诚最后确定了“自觉较合理想”的名单。吴国桢这时却突然提出要求，“以财政部长人选不能与其省府合作，要求其自兼部长相胁”。蒋对此颇感意外，意识到吴背后有美国人撑腰，“余以名单已定，而且已提常会，不能改动告之，而彼仍要求不置，美使馆亦间接表示支持国桢，心滋不怿，最后仍照原定名单提案通过，不管美国之态度如何也”《蒋介石日记》（手稿本），1950年3月11日……当此失败之际，如何重新集结力量，渡过难关，同时要安抚老政客，不致引起太大的混乱，确实是棘手的难题。3月12日，国民党正式公布了其退台后的第一届“行政院”内阁成员名单：
行政院院长陈诚
副院长张厉生
内政部长余井塘
国防部长俞大维
外交部长叶公超
财政部长严家淦
经济部长郑道儒
交通部长贺衷寒
教育部长程天放
司法行政部长林彬
蒙藏委员会委员长余井塘(兼)
侨务委员会委员长叶公超(兼)
政务委员吴国桢
蔡培火
董文琦
王师曾
杨玉滋
秘书长黄少谷
国民党政权败退台湾，庞大的政权结构与官僚体制和狭小的统治区域产生了矛盾，政出多门，非常混乱。陈诚“组阁”前，台湾省政府比“行政院”更有实权，尤其在财政方面。蒋介石需钱，常常直接找台湾省财政厅长，而不是找“经济部长”。“陈诚内阁”的成立，标志着“行政院”权力的部分恢复。为了适应台湾的环境，陈诚对大陆时期“行政院”下辖十多个部会的庞大机构动手精减，确定了“八部二会”的新构架。“八部二会”构架后来沿用了很长时间。