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談到新「內閣」人選，陳誠表示，「本人將遵總統訓示，為施政最高之原則，本此原則選賢與能」《中央日報》，1950年3月9日……隨後，陳誠赴草山蔣介石住所，請示「行政院」各部會首長人選問題。
3月10日，蔣介石下達「總統令」，解散「閻錫山內閣」，任命陳誠為「行政院長」。同一天及次日下午，蔣介石連續主持召開國民黨高層會議，討論陳誠所提「內閣」人選問題。陳誠「組閣」也是困難重重，吳國楨開始堅持不合作態度，蔣介石再三規勸，有意讓其擔任「副院長」兼任台灣省政府主席，但吳「堅執不允」《蔣介石日記》（手稿本），1950年3月4日……蔣又邀吳國楨夫婦聚餐，宋美齡也利用與吳的關系來調解，「勸告其強勉忍耐，與陳合作」。陳立夫、王世杰等人都希望在「內閣」中有自己的位置。這使蔣在用人方面非常頭痛，花很多時間「煞費苦心」，而且用人與不用人「不能明示理由，只有受人不諒之苦心而已」。﹏﹏a.
3月11日，他與陳誠最後確定了「自覺較合理想」的名單。吳國楨這時卻突然提出要求，「以財政部長人選不能與其省府合作，要求其自兼部長相脅」。蔣對此頗感意外，意識到吳背後有美國人撐腰，「余以名單已定，而且已提常會，不能改動告之，而彼仍要求不置，美使館亦間接表示支持國楨，心滋不懌，最後仍照原定名單提案通過，不管美國之態度如何也」《蔣介石日記》（手稿本），1950年3月11日……當此失敗之際，如何重新集結力量，渡過難關，同時要安撫老政客，不致引起太大的混亂，確實是棘手的難題。3月12日，國民黨正式公布了其退台後的第一屆「行政院」內閣成員名單︰
行政院院長陳誠
副院長張厲生
內政部長余井塘
國防部長俞大維
外交部長葉公超
財政部長嚴家淦
經濟部長鄭道儒
交通部長賀衷寒
教育部長程天放
司法行政部長林彬
蒙藏委員會委員長余井塘(兼)
僑務委員會委員長葉公超(兼)
政務委員吳國楨
蔡培火
董文琦
王師曾
楊玉滋
秘書長黃少谷
國民黨政權敗退台灣，龐大的政權結構與官僚體制和狹小的統治區域產生了矛盾，政出多門，非常混亂。陳誠「組閣」前，台灣省政府比「行政院」更有實權，尤其在財政方面。蔣介石需錢，常常直接找台灣省財政廳長，而不是找「經濟部長」。「陳誠內閣」的成立，標志著「行政院」權力的部分恢復。為了適應台灣的環境，陳誠對大陸時期「行政院」下轄十多個部會的龐大機構動手精減，確定了「八部二會」的新構架。「八部二會」構架後來沿用了很長時間。