尸災發生後一個月，幸存者們樂觀的重建計劃，被一場突如其來的怪雨打亂了。
這是一種含有大量病原體的奇怪雨水，很多幸存者因為接觸了這種雨水而被感染尸變。雨水不僅能使接觸它的人類感染成喪尸，而且還能讓浸泡過這種雨水的喪尸進一步變異。對于幸存者來說，這是一場災難，但對于喪尸來說卻是上天的恩賜。怪雨降臨後沒多久，少數喪尸開始變異了。
這些經過怪雨雨水滋潤的「活死人」們，只要可以獲取足夠的新鮮血肉，就能進化成很難打死的「怪物」。
一部分變異的喪尸獲得了巨大的力量，身體也變得堅韌了起來，它們已經不再是手拿簡單工具的幸存者能夠消滅的了，人們將它們稱為力量型喪尸。
另一部分喪尸怪雨的催化下變得非常敏捷，速度很快，活月兌月兌成了一只只喪尸猴，它們被幸存者們稱為速度型喪尸或者敏捷型喪尸；
還有個別走運的喪尸，變成了一種可以控制其它喪尸的怪物，它們被稱尸王，也叫掌控型喪尸。
這些只佔極少數的變異喪尸，開始帶領著尸群一步步將反撲的人類幸存者打壓下去……具體情況參考生化危機系列……好在能夠得到足夠食物發生變異的喪尸只是極少數，因此不足以將人類幸存者趕盡殺絕。
幸存者們的武器對普通喪尸來說是利器，但對于那些皮糙肉厚力氣很大的變異喪尸來說，就起不了多少作用了。而那些速度較快的進化喪尸更是幸存者們的惡魔，夜襲的它們可以輕松攻克幸存者的防御工事。
一幕幕幸存者團隊被尸群瓦解消滅的慘烈畫面，成了不多的躲過病毒爆發初期的幸存者們，最後的記憶……
上天似乎是公平的，在喪尸進化後不久，天空又降下了一場能使人類變異的怪雨。只是上次很多幸存者淋雨後變成喪尸的慘烈教訓，大部分幸存者們都錯過了，只有少部分人因為意外淋到或者喝到這種怪雨發生了變異。
不僅是喪尸和人類，很多動物通過它們各自的經歷，也紛紛變異進化了。其中很多變得巨大強悍，有些物種甚至獲得了一定的智慧。它們和喪尸一樣，爭搶著各種生存資源。人類已經接近滅絕的邊緣……
災難帶來的不僅僅是這些，全球氣候突然變得怪異起來。各地的氣候變成了沙漠氣候，炎熱和嚴寒反復頻繁交替著，干旱和怪雨使得植物幾乎全部枯死了，很多地方甚至發生了嚴重干旱……缺水缺糧煎熬著幸存者們……
終于在喪尸災難發生後近一年後，世界各地紛紛降下一場能嚴重腐蝕金屬的雨水後，全球氣候突然恢復正常。這種酸雨對幾乎所有金屬都造成了嚴重腐蝕，人類曾經制造的各種機械在怪雨下成了一堆堆銹渣。就在幸存者們為各種金屬制品惋惜的時候，久違的植物卻發芽了。是的，那些幾乎絕跡的植物終于發芽了……不過這些重新生長出來的植物也幾乎都變異了……