神農功德圓滿，掛冠而去已有月余。
軒轅卻開始苦惱了。那就是地皇神農沒有把原華胥部落的首領之位，傳給軒轅，而是傳給了自己的八代世孫，而軒轅也是有熊部落的首領。
在神農在位時，軒轅跟隨神農學習治理天下之道，並輔佐神農的世孫治理華胥部落。因為兩人齊心協力，華胥部落不斷發展成為天下之望。神農八代世孫發明農具，以木制耒，教民稼穡飼養、制陶紡織及使用火，以功績顯赫，以火得王，故為炎帝；而軒轅劃野分疆，定八家為一井，三井為一鄰，三鄰為一朋，三朋為一里，五里為一邑，十邑為都，十都為一師，十師為州，分天下九州，是以土德王天下，土色黃，故稱黃帝，世人將二人並稱「炎黃二帝」。
世人不知道軒轅是天定共主，一直以為炎帝會即位，黃帝為輔。沒想到地皇神農將共主之位傳給黃帝。這下華胥部落的族人接受不了了，而後華胥部落有被黃帝更名華夏部落，就連炎帝都覺的是黃帝在消弱自己的影響力；而其他部落已經習慣為華胥部落馬首是瞻，一個不是華胥部落首領的人成為天下共主，也一個個不知所措。
這時九黎部落首領蚩尤以軒轅明正而言不順，人心相悖為由，拒絕尊黃帝軒轅為天下共主，南方各部落以蚩尤為首，成立九黎聯盟挑戰共主。
隨後炎帝也以華胥部落首領名義驅逐黃帝回有熊部落，雖承認黃帝共主之名，但也以共主只有建議權而無決議權，拒不接受黃帝之命，華胥流域部落通通跟隨，形成華族部落聯盟。
黃帝返回有熊部落，以共主之名收攏周邊大小部落，組成黃帝族部落聯盟。一時間人族分裂成三個巨大部落聯盟，鼎立在洪荒大陸。
那分裂的帝氣也在第一時間紛紛找到新的宿主。黃帝，炎帝，蚩尤身據五爪金龍之氣。黃帝手下四將應龍，女魅，倉頡，力牧，炎帝麾下春夏秋冬四將和公主精衛，蚩尤座下後卿，刑天，共工，夸父，身盤四爪龍蛟。下屬各個部落首領領三爪青蛟之氣。大戰氣息一觸即發。
伏羲看著從帝氣上傳來的消息，抿嘴一笑，對著神農說道︰「听到他們的名字，我還以為祖巫復生了，這是幾個後輩，居然敢用祖巫的名諱。不怕平心娘娘不讓他們輪回！」
神農笑道︰「皇兄過濾了，不說他們身體里有巫族之血，就算沒有平心娘娘想必也很高興在听到這些名字再威震天下。而且他們不是還知道避嫌嗎，那個明顯是娘娘後裔的女子不是只叫做‘後卿’嗎？再說這還不是皇兄你的謀劃。」
不久前，神農忽然接到伏羲的密旨，讓他給炎帝的四大將賜名以示其功績。隨後神農賜炎帝四將為春之木神句芒，夏之火神祝融，秋之風神天吳，冬之霜神玄冥。
隨著神農的賜名，天下人族大能者都以古時強者自名。一時間洪荒四洲仿佛回到上古無序時代，許多「大能」重現于世。
伏羲正色道︰「這是平心娘娘的要求，昔時我欠她一個人情啊！她這是一石二鳥啊，利用人族大能的影響力，消除人族對巫族在巫妖大戰中坐視人族被屠戮之怨，有利用人族信仰，重聚巫族氣運。」
「什麼？巫族要現世？皇兄，這可怎麼是好？」神農大驚失色。
「不要緊的，平心娘娘只是想為巫族留下一些血脈，就像上古時代，兩族通婚一般。這之後輪回便可利用信仰之力將巫族之血，融入靈魂，她認為這是巫族。我們可以以為他們是人族。這是雙贏，我們人族實力加強，平心娘娘也可以了卻因她而幾乎滅族的巫族因果。」
「原來如此，皇兄果然深謀遠慮啊！」
伏羲自嘲的笑笑，想著︰「穿越者就是這點好，順應‘歷史’就是無往不利。怎麼也想不明白怎麼有那麼多人在實力不足的時候就想這逆天。天要是那麼好逆，鴻鈞早就成功了。可是什麼也不改變，我也算不上穿越者啊！」
炎帝最近很忙，部落合並，重組，部隊建設，農田開墾，一件件都需要他親自去做。炎帝回到住屋里，還沒喘口氣，就听到有人求見。炎帝看著眼前的這個自稱蚩尤部落的來使，听听蚩尤有什麼說的。
九黎來使鄭重的說︰「我家大王前來尋求聯盟，你我兩部落合力清除黃帝勢力，再做生死，以定天下共主。若我們開戰軒轅則利用共主之名收攏天下甚至是你我手下勢力，最後無人可制，我們白白為他人作嫁。」
炎帝勃然大怒︰「蚩尤的意思是我打不過那個被我灰溜溜趕走的家伙。還是說他蚩尤打著聯盟的幌子，實際上吞並我的勢力。告訴蚩尤，共主也就是我這個血統純正的人來做，就算不是我，也輪不到他那個留著外族之血的家伙的人來做。」
蚩尤听著屬下的回報，看著渾身顫抖的下屬，微笑的問道︰「你很冷嗎？」
「屬下不冷。」
「那你抖什麼，是怕我嗎？」
「首領饒命啊，屬下只是如實回報啊，沒有自己的意思啊。首領！」下屬早听說過蚩尤首領很忌諱被人說道他的血統。好幾個不知死活的部落首領嘲笑首領，不只自己被活活打死，連部落族人都被屠戮的干干淨淨。現在自己這麼說能不害怕嗎，不說實話一定會死，而且會死定很慘說不定還會連累自己的家人，說了反而可能不會死。所以才戰戰兢兢的實話實說。
「忠心可嘉，很好，你的家人部落會照顧的，你去吧！」听道蚩尤這麼說，這個下屬不再害怕了，感激的對著蚩尤感恩戴德。
「噗」的一聲，身體被一個黑色之矛貫穿，驚愕的看著蚩尤，仿佛听到蚩尤陰柔的說道︰「你去吧，你去死吧！」
「你又這麼做了，蚩尤。小心眾叛親離哦！」
「那你會不會背叛我啊，我的兄弟，刑天！」
「不會，我說過，你就算要與世界為敵，我也會站在你的身後。」
「那不就是了，我只需要族人怕我就好了。我不需要他們敬仰，他們听話就好，我會給後人留下一塊生存之地的，不是嗎，大巫刑天！」
「希望我們在人族能一直走下去，是不是，十三祖巫。」伏羲還是被平心算計了，可憐的娃啊！
「炎帝真的會起兵反抗黃帝？」刑天問。
「一定會，剛剛你也听到了，炎帝十分以自己的血統為傲。他不屑與我這個‘雜種’為伍，你以為他會忍受黃帝那個庶民壓在他頭上嗎？我派人去就是刺激一下他。」蚩尤粗獷凶狠的外表下有一顆玲瓏的心。
三日後，炎帝起兵伐黃帝。