皇歷2o1o年中立國日本被神聖不列顛帝國征服，成為了殖民地十一區。七年後，一個名為的Zero反叛者站了出來，率領黑色騎士團向不列顛起決戰。然而，戰爭卻以黑色騎士團的失敗和Zero死亡載入史冊……
阿什福德學園，又熱熱鬧鬧的開始了新的一天，雖然一年前的那場黑色叛亂，這里也不可避免的被殃及了，一度也讓叛亂軍當作據點使用，可是現在這里已經完全看不到戰爭痕跡。偶爾說起黑色叛亂，還是讓一些親身經歷這場叛亂的導師和學生有些後怕。
教職員辦公室里，坐在辦公椅上的剛下課回來的維雷塔疲憊的嘆了一口氣，活動了一下自己酸的肩膀。低頭看看自己安排的滿滿的課程安排維雷塔就覺得累，整天跟這幫不安生的學生打交道，讓她覺得比原來在軍隊里還累。尤其是那個園長的孫女，最讓她頭疼。
不過為了男爵地位，維雷塔再怎麼不情願也要忍著。想想這樣的生活也持續不了多久了，只要解決了眼前這個問題，自己就能再升一級了……維雷塔愜意的舒了口氣，翻開手上的點名冊上。其中一個缺勤最多的少年馬上映入他的眼簾，維雷塔原本放松的表情變得緊張起來，「魯魯修•蘭佩魯基……」
誰能想到這個少年就是一年前那場叛亂的策劃者——Zero，他同時還擁有一種名為「gess」的可怕力量，自己也體驗過這種力量，之後……
想到這維雷塔臉色難看起來，伸手按摩起有些疼的頭。這時手肘不小心踫開了一卷十一區今天的日報，日報的頭條就是《不列顛外交部再次要求中華聯邦驅逐在九州地區的黑色騎士團殘黨》。
九州，一年前迫于當時黑色叛亂的壓力，不列顛為了穩住中華聯邦捏著鼻子承認了中華聯邦在九州的合法性。九州現在名義上是不列顛和中華聯邦的共管區，實際上已經被中華聯邦吞下了。
看到黑色騎士團殘黨的這個詞匯，維雷塔的臉色不由更加難看了。一年前，在叛亂被鎮壓的前夕，一個臨時接替指揮的人在戰爭還沒有結束的時候，沒有通知前線的同伴情況下，帶著少數人悄悄的跑了。最終被在海上觀望的中華聯邦海軍以接應僑民的借口，接應到了九州。
不列顛原本認為失去Zero的黑色騎士團一定會一蹶不振，而這些流亡到九州的殘兵敗將更掀不起什麼風浪。可結果讓人想不到是，這幫黑色騎士團的余孽在安省了不到一個月，就以九州為基地，在中華聯邦和eu的暗中鼓勵下騷擾起不列顛的殖民地。由于十一區在上次黑色叛亂之後成為了不列顛關注的重點，重兵壓陣之下，沒法展開行動的他們就跑到兵力有些薄弱的中東沙漠，跟那里的恐怖分子攪合在一起。等不列顛拆東牆補西牆加強中東地區部署的時候，他們又出現在南洋熱帶雨林里，跟那里的土著游擊隊成了好同志。
雖然對不列顛來說，這些騷擾算不了什麼。可這像蒼蠅的東叮一下，西叮一下的實在是讓人心煩。當然還有一個嚴重的問題，那便是黑色騎士團的國際知名度是越來越高了。據說連北非戰線的不列顛軍指揮都說，他那里都已經出現借著黑色騎士團的大名給自己壯膽的反叛者了。
這些讓不列顛頭疼之極的黑色騎士團余孽，被國際上稱為——「最後的大隊」。
而這個「最後的大隊」的大隊長，不列顛也透過俘虜口供查出了一些資料。這個人是中華聯邦人，曾經是黑色騎士團第二戰力，還以兩次力挫不列顛軍的偶像柯內莉亞而聞名。不過任誰都沒想到這麼一個英雄般的人物，竟然會在戰爭結束前就拋下同伴倉皇而逃。關于這個指揮官的影像資料很少，相比于戴著面具的Zero，他倒是很少在媒體面前露面，唯一的影像只有……
維雷塔舌忝了舌忝干的嘴唇，猶豫了會兒把手邊的報紙展開，報紙上印著一張照片。這張照片是一年前黑色叛亂的前夕，Zero在特區會場誓師的時候所拍下的。Zero當然是主角，在他的身後站著京都六家的代表和黑色騎士團其他干部，在照片角落的一個有些模糊的人被畫了一個紅圈。下面注釋著這個人便是現在聲勢顯赫的大隊長閣下。只是大隊長閣下的表情很怪，準備來說跟他身旁的眾人都瘋狂歡呼「Zero」的時候相比，他未免太過「淡定」了。而且他看Zero的眼神很耐人尋味……
維雷塔神色復雜的看著這個被不列顛稱為大隊長的人，嘴里不由說出了這個人的名字，「盧森保……」
……
九州福岡軍事基地外，穿著一身黑色騎士團團服的輝夜竹曲站在海岸邊瞭望對面的本州。
一年前，黑色革命失敗前夕，現在的代理總指揮下令撤退。輝夜竹曲認為這是懦夫的行為，他認為就算是失敗，就是死亡也要留下來和大家一起面對。當時很多人都是這樣的想法，可是代理總指揮卻說，「只有活著才能辦到更多的事……」或許他們還有些不甘心就這麼死了，或許他本來也就不願意死，所以他們也把這樣的歪理當作了苟活的借口。
輝夜竹曲想起剛剛狼狽的逃到九州時候，這里的日本人用鄙夷的眼神看著自己這些殘兵敗將，在背後指指點點的說什麼「逃兵」「敗北主義者」「拋棄同伴的膽小鬼」，這讓輝夜差點就受不了要自殺，可是現在在自殺那就是逃避了，不折不扣的懦夫行為。活著有時比一死了之需要更大的勇氣。
「喂，輝夜！大隊長讓全體集合了。」
輝夜竹曲轉身看著一個同樣穿著黑色團服的年輕人一臉笑嘻嘻向喊道，這個人叫秋元里奈，這個人讓輝夜總感覺沒心沒肺的，現在所有人都是抱著內疚和羞恥的心態活著，可是他像是什麼事也沒生一樣，整天嘻嘻哈哈的。
「是代理總指揮。」輝夜很是無奈的糾正道。「最後的大隊」是不列顛對他們這些黑色騎士團余黨的稱呼，但漸漸的外界都稱呼他們為「最後的大隊」，現在團內的一些人也開始以這個自成了，如此一來身為「最後的大隊」的指揮官當然也就自然而然的是大隊長了。
一提到那位大隊長，輝夜的臉色就沉重起來。這個大隊長原本在黑色騎士團也算個名人，在黑騎無人的情況下成了黑色騎士團的代理指揮。輝夜刻意咬死「代理」這兩個字，因為在他心目里Zero才是日本救世主，雖然Zero在上次革命的時候突然失蹤，但輝夜相信Zero一定去辦更重要的事了。現在的大隊長雖然在這一年來也顯示出一些不凡，帶著他們各處騷擾不列顛其他的殖民區，而且似乎很清楚的不列顛軍的作戰方式，總能抓住漏洞逃過不列顛的圍剿，但終究只是過渡時期的代理。
Zero一定不會那麼容易的死掉！Zero一定還活著！輝夜一直希望和等待著Zero的重現。
輝夜就這麼滿懷心思跟著秋元里奈到了集合地點，這里已經站滿了穿著黑色團服的人，這便是「最後的大隊」。一個身穿與普通團服有些不同的人，慢慢走上了台上。
「列隊！恭迎大隊長閣下！」秋元里奈雙手放在嘴邊笑嘻嘻的喊了起來，絲毫也不管身旁的人郁悶的表情和台上那個人苦笑的表情。
「諸君，還記得一年前的黑色革命嗎？」「大隊長」一開場突然說起這個，這讓在場所有人臉色都是一變，黑色革命對于這些人來說是一個不能提的禁忌字眼，眾人這一年來都是在刻意回避這個字眼。可現在「大隊長」卻當眾提出。
「在那一天如同喪家犬一般的倉皇逃竄，像臭蟲一樣被追得滿地亂爬。理想，同伴，甚至是尊嚴，都被拋的一干二淨，一切都為了自己的苟延殘喘。不顧前線還在浴血拼殺的同伴，自己偷偷的逃走了。這真是自私，真是無恥，真是惡心，真是令人唾棄。」這麼不留情面的話，讓下面的人臉色都灰暗起來。
「可是你們真的甘心背著這樣的名聲，躲藏一生嗎？一邊虛偽的說著「對不起」，一邊繼續卑劣的活著嗎？」
輝夜竹曲緊咬著牙盯著台上那個人，都是這個人毀了自己這些人的一生，現在居然還有臉在說這個。
「我們為什麼還要活著？」「大隊長」說著張開雙臂像是要擁住什麼，大聲的說道，「因為我們要證明！活著能比一死了之辦的事更多！」
「歪理！」輝夜竹曲看著周圍的人又炙熱的起來的眼神低聲罵道。究竟有多少無恥小人以此為借口，來掩飾自己的懦弱。
「現在我要如約把大家帶回去了。」「大隊長」終于說出了這場會議的中心。
「要回去了？」
「真的，假的。」
「回到……」
每次說要重新回到對面的本州，可是「大隊長」總是說時機未到，可現在時機怎麼到了？下面喧鬧起來了。秋元里奈當然不會錯過這個機會，又大聲喊了起來︰「大隊長閣下！大隊長閣下！」不過這次倒是帶動了其他人喊了起來，
「代理總指揮！代理總指揮！」
「我是一個值得信任的領袖……」沒有人注意到「大隊長」低聲的自語，和他右眼的那一抹紅光。
「說的沒錯！」這時入口出突然響起一個女聲，把眾人的眼光吸引了過去。入口處站著一個身宮裝的少女。
「神樂耶大人。」眾人都安靜了下來，給前往會台的神樂耶讓出了一條路，神樂耶一邊微笑著跟周圍的團員招手示意，一邊快步走到了高高的會台前。看看到自己胸前的會台，個子依舊沒怎麼張的神樂耶歪著頭楚楚可憐的望著台上的「大隊長」，看的「大隊長」只好彎下腰伸出手要拉她上來。
「神樂耶大人怎麼突然從洛陽回來了？」「大隊長」把神樂耶拉上來的時候小聲問道。
「這種時候我要不回來的話，就麻煩了。」神樂耶笑了笑輕聲說道。上台後，沖著下面的團員說道，「我們一定要去找回Zero！Zero一定會理解大家的！我們這次回去要在Zero的帶領下重現黑色騎士團的榮光！」
神樂耶身後的「大隊長」無聲的笑了起來。
今年是皇歷2o18年，正如當初所說的一切才剛剛開始……-
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