巴哈魯在齊格死後，自然成為進山清軍的最高統領，其他清軍參將，即使和他平級，可又有誰願意得罪這個有後台的滿洲「大爺」。
麒麟山是不用再圍剿了，「叛民」們早就不知去向，于是巴哈魯命令剩下的清軍準備撤回漳州，臨走的時候，還不忘記在長汀城搶掠一番。永歷沒舍得動的城內的富戶和老百姓卻遭了秧，金銀細軟被如狼似虎的清兵搶個干淨，貌美的女人也放不過，城內百姓稍有反抗，便遭屠戮，真是不知道誰是「土匪」？
在清軍往回撤的時候，在南面大路的山口又踫見了一支去東南方圍剿的清軍，等到會合後，清軍達到了三千余人，損失還不算大。在巴哈魯連蒙帶嚇的要挾下，所有清軍將官答應在回到漳州後口徑一致，將戰損的責任都推給「死鬼」齊格。
後來，回到福建總督駐地後，巴哈魯等面見總督吉力嘎的時候，只字不提自己「全軍覆沒」的事，而是添油加醋地描述了一番︰齊格如何失策，如何的「分兵圍剿」，如何被土匪「調虎離山」而致長汀城守衛空虛，被土匪乘虛而入，最後齊格突圍戰死，不過各路清軍在巴哈魯的率領下如何的奮戰反擊奪回長汀城，眾將是如何的擁戴巴哈魯等等。不但將責任全推給了齊格，還自吹自擂的一大通。
至于麒麟山的土匪和叛民，巴哈魯繪聲繪色的描繪了一番，土匪有五六千人，甚至有可能得到了鄭經的支援，擁有大量的火銃等等，不過在他英明的指揮下，消滅了大部分土匪和叛民，麒麟山已經不再是威脅雲雲。
吉力嘎不是傻子，當然听出其中肯定有貓膩，可是齊格人都死了，死無對證，麒麟山又沒有什麼消息傳出。再說巴哈魯可是鰲中堂公子的小舅子，可不是輕易能得罪的，不如就信他一回，做個順水人情，向朝廷為巴哈魯表功，也好早點把這位「小舅子」送走，留著他就是大的麻煩。
于是兩個月後，北京的嘉獎令傳到福建，巴哈魯得償所願，官升兩級，被任命為正三品正藍旗副都統，即日回京上任。在巴哈魯臨走的時候，除了滿心歡喜外，還想著一個人。那天給我出主意的黃先生足智多謀，還真讓他算準了，這麼快就升官了，要是能把他招攬到身邊，做一個師爺，時刻給自己出出主意，用處還是很大的，巴哈魯修書一封讓人想辦法去麒麟山給這位「黃先生」送去，邀請他去北京給自己做師爺，又許諾了好處若干。
明軍向西北方向轉移，只是權宜之計，等清軍退兵，永歷立刻率領明軍返回了長汀城，本來是要繞過長汀城的，但是永歷听探馬回報說清軍臨走的時候，打著「私通土匪」的旗號洗劫了長汀縣。于是永歷讓黑山帶領大隊人馬先回麒麟山，以接應返回的百姓。而永歷自己帶了一隊護衛，直奔長汀城。
等進了城後，見到是滿目瘡痍，街道是好多頭纏白布出殯的人，大大小小的棺材一直綿延出好遠，有的甚至是櫃子裝和草席卷了了事，哭聲傳出四五里。
「真不應該留著巴哈魯這狗東西啊！」永歷知道自己犯了很大的一個錯誤，為了保存實力，卻讓百姓遭殃，雖然是事先沒有預料到的，但畢竟與自己有關。
「以後再找你算賬，巴哈魯，朕再見到你非扒了你的皮！」永歷恨恨的說道。
身邊的黃宗羲也自覺不忍，愧對百姓，連忙跪下說道︰「陛下，此計是臣所出，卻給長汀城的百姓帶來了無妄之災，臣有罪！請陛下降罪！」
「起來，以後要多加注意，在做任何事前，必須把百姓想到前邊！」永歷說道。
永歷是穿越來的，腦袋里有新思想，可黃宗羲也不差，要知道他是最早提出「天下為主，君為客」思想的人，在此時也算是「激進派」了，所以當永歷提出「把百姓想到前邊」時，黃宗羲激動的又是一頓叩頭行禮，如同找到了「知音「一般，著實激動一番。
「陛下，清兵已經把長汀縣的百姓搶光了，就連糧食也沒有剩下，這春節即到，百姓如何撐過年關啊？」黃宗羲將自己的擔憂說了出來。
「想想辦法，一定要讓長汀城的百姓有飯吃，這回咱們帶來的一萬兩軍費，先拿去買糧，然後分給長汀縣的百姓，至于麒麟山的軍費，再想想別的辦法。」永歷認為最重要的，就是不能有人餓肚子，更不能有人餓死。心里想到︰百姓是大明的百姓，朕不管，誰管？
察看完長汀城，永歷帶人迅速趕往麒麟山與靳統武他們會合。等到了麒麟山，看到的就是一片廢墟，在清軍退走的時候，一把火燒光了這里，一切又得從頭開始。
現在麒麟山的明軍還比較弱小，經過此次大戰後，傷亡七百余人，但是活下來的，卻是精銳的戰士，經歷了這場戰役，麒麟山的明軍有了「質量」上的飛躍，從「精氣神」就可以看出，在生死搏殺中拼出來的明軍戰士，渾身上下充滿了蕭殺之氣。
有一得，必有一失。雖然麒麟山被燒個精光，卻得到了一千精銳的戰士。房子沒了，可以重建；有了精銳的戰士，就可以打天下。
永歷又將參戰的諸將表現，與黃宗羲和靳統武二人進行了一番探討。得出了結論是黑山作戰勇猛，但是「土匪」習氣太重，雖然在後期有所改進，但在將來指揮作戰方面還需要加強，才堪為大明軍的將領；方孝玉有勇有謀，在作戰中指揮有方，正在快速的成長起來，相信不久就可以成為獨當一面的大將；李嗣興沒有了以前的毛躁，表現的中規中矩，這也是不錯的進步；金川在戰斗中沒什麼表現，卻在後勤方面做的不錯，起碼沒讓幾千人餓肚子，值得表揚；楊俊因為負責疏散麒麟山的百姓，但事先安排有誤，致使兩千多百姓被清軍殘害，其中主要是楊氏族人；表現最精彩的是小洪熙官，在亂軍中取敵將首級，機智勇猛，屢立戰功，年紀雖小，前途不可限量。
在永歷的頭腦中，早就有一個想法，如果說現在有四個「根據地」的話，那麼就應該相應的設立四個軍團。井岡山是「中央根據地」，設立第一軍團；麒麟山距離井岡山較近，地理位置重要，設立第二軍團；梅山是第一個開拓的「根據地」，設立第三軍團；為了安撫新近準備歸附的劉體純，設立他的部隊為第四軍團；最後是在滇黔邊界的劉震所部，設立第五軍團。
以上計劃準備在返回井岡山，召開「根據地」大會的時候宣布，至于每個軍團的軍團長和其他指揮官的配置，等回去再行商議。
永歷從來不吝惜封官許願的，反正官職是隨口封的，只要不太過分，大臣們也沒有意見。對于「麒麟山反圍剿」勝利的有功之臣，按照各自的表現，晉封黑山為長汀伯爵，賞玉佩一塊和《孫臏兵法》一本；方孝玉升正三品蕩寇將軍，不再任御前統領；李嗣興本是晉王世子，不能再另封爵位，賞瓖金短槍一支（回去再給）；金川掌管軍需有功，由武職轉為文職，擢升正三品江西巡撫（有名無實）；洪熙官少年英雄，陣斬參將一員，晉封御前統領，正四品；楊俊失誤免官，跟隨回井岡山進行學習，再做任用。
麒麟山的明軍將改編為第二軍團，軍團長為黑山，方孝玉任政委兼副軍團長，隨行的刀盾連、長矛連和火槍連留在麒麟山，編入第二軍團。
其他人都有封賞，只有楊俊免官，不過楊氏父子已經對此相當感恩了，畢竟被殘害的大部分是自己的族人，楊俊甚至想要自裁謝罪，被永歷勸慰後，才稍微安定下來。
短期內，清軍是不會再進犯麒麟山，而且「根據地大會」也快要召開，永歷準備馬上趕回井岡山。黑山作為第二軍團軍團長隨行，方孝玉留在麒麟山，著手對第二軍團進行整頓改編。
永歷走時，單獨與方孝玉密談，留給他的任務是依靠長汀的百姓，盡快擴編第二軍團，以應對即將到來的大戰。
兩天後，出發回井岡山，永歷歸心似箭，想必自己的第一個皇子已經出生了！
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