回到木葉後，追擊小隊任務失敗的消息傳了回來，丁次，寧次受重傷，生死不明。鳴人，牙傷勢較重，鹿丸和小李輕傷。經過綱手和醫療團隊長達2天的全力救治，丁次和寧次月兌離了危險。
閑暇無事的林陽委托日斬，幫君麻呂辦了個戶籍登入，雷霆小隊終于成為滿員小隊。林陽決定先不干什麼忍術研發的工作，領著自己的雷霆小隊接些高等級的任務進行磨合。
很快林陽的身體出現了個大問題，就是查克拉量下降的越來越明顯，一開始林陽並沒在意，直到最近出的戰斗任務越來越多，這個問題越來越嚴重。面對如此嚴重的問題，林陽不得不暫停所有任務，將任務轉交給木葉的其他忍者小隊完成。
「小戒，我的身體到底出現什麼問題？」回到家後的林陽將自己關閉在小屋里。
「主人，經過檢測，你的細胞毀壞了一部分，雖然長出了新細胞，但卻跟以前一樣，是個空殼工廠，不能制造查克拉。」神戒緩緩解釋道。
林陽聞言一愣，隨後皺起眉頭問道︰「我原來不是將130兆細胞全部改造過了嗎？怎麼還會出現這種情況？」
「主人，你還沒听懂嗎？這不是細胞改造的問題，而是你體質根本上的問題，人在生活中難免出現磕磕踫踫，這些情況都會造成細胞死亡。而這時候，人體會自動生成新的細胞來替代死亡的細胞。像原先的比喻，主人你的身體細胞如同空殼工廠一樣，而現在工廠里的設備都是進口的，主人自身卻沒有制造這些設備的能力。因為工廠遭到外力作用被毀滅了，這些設備自然也就毀壞了，主人又沒進口設備，自身也造不出這種設備，那新工廠就跟原來一樣，就是個沒有任何生產力的空殼工廠。」神戒見林陽腦袋還沒轉過彎來，費了一番口舌才讓林陽明白問題出在哪了。
林陽苦惱的抓起頭發說道︰「那怎麼辦？我總不能再去抽鳴人的血液吧？鳴人已經不再是以前那個傻乎乎的樣子了。」
「其實辦法是有的，就是讓我升級，增加新功能，然後從根本上解決這個問題。」神戒沉吟道。
「小戒，你還能升級？」林陽疑惑道。
「當然了，什麼叫萬能神戒，難道你覺的我就這幾項功能，就能稱為萬能神戒嗎？」。
「也是哦，小戒你的稱號是萬能神戒，我一直感到很疑惑，你功能那麼少，跟萬能神戒這個名字完全不相符。感情是可以升級的，小戒，你升級下需要多少能量？」林陽問道。
「需要非常龐大的能量點，這也是我為什麼一直沒說的原因。」
「到底需要多少？」
「1兆能量點，相當于一個小型靈礦脈的能量。」小戒緩緩說道。
「咕嚕」林陽咽了下口水，表情呆滯的看著手上的戒子︰「小戒，你確定你沒開玩笑嗎？」。
「嗯，就是1兆能量點，這級升完後，下級升級的能量點就要乘10倍，10兆能量點。」
「啊，難道以前的主人就沒想要幫你升級過嗎？」。林陽抓狂的問道。
「以前的主人是強者，覺得花費如此多的能量來升級完全沒用處，所以就沒升級過了。」神戒悶悶道。
「……」林陽淚流滿面啊，我很需要啊，前任你個吝嗇鬼，我鄙視你。
林陽苦惱的抓著頭發，如果按照自己的查克拉來轉換能量，估計等自己成一堆枯骨，神戒也升不了級，只能將目光放在那些充滿能量的石頭上。林陽冥思苦想，片刻後一拍手，開心喊道︰「格雷爾石礦脈。」
「什麼格雷爾石礦脈？」神戒好奇問道。
「火影世界里有個礦脈，里面蘊含著能炸掉半個世界的能量，小戒，你能不能吸收這種能量？」
「不清楚，不過一般是可以的。主人，那個礦脈在哪？我們現在就去挖空他。」神戒興匆匆的問道。
「等等。」林陽起身，從書架上取了一副地圖，然後開始回憶起火影忍者第二劇場版的劇情，根據劇情提示，劇情開始時砂隱村的海上邊境被襲擊，林陽連忙開始查起地圖，發現風之國接壤海邊的地方，是南部地區，也就是說，整個風之國的沿海地區都是林陽的排查對象。
林陽操起地圖便跟家人道別下，領著雷霆小隊匆匆離開木葉，越過河之國，來到風之國南部地區，開始暗中走訪，尋找著自己記憶里那些相熟的場地和那只商隊。
經過一個多月的探訪和重金懸賞，林陽終于找到了那只商隊，在林陽懲戒之眼的幻術控制下，那老頭子領著林陽一干人來到封印礦脈的地方。
進入封印室後，林陽讓老頭子打開封印，只見封印室的屋頂如同花朵一般張開，林陽看著碧綠色的液體礦脈，內心充滿激動︰「小戒，這個礦脈能轉換成能量點嗎？」。
「能，主人，這些都是靈液啊，比靈石靈晶更高檔的礦脈，不過是乎有些暴走的傾向，主人，我們趕緊上去將這些靈液處理下吧。」神戒激動道。
「好的。」林陽交代白等人留在這邊，終身一躍，飛速竄入靈液湖泊里，一進入湖泊內部，林陽就讓神戒將這些靈液全部進儲物空間里。只見右手的神戒產生一陣漩渦，瘋狂的吸納靈液，很快整個靈液湖泊都消失的干干淨淨的，周圍牆壁散發著瑩瑩的碧光。
「主人，周圍還有些上品靈石和靈晶，把它們都扣下來。」
「好 。」林陽攀附在四周的岩壁上，開始瘋狂挖起靈石和靈晶，收入儲物戒子里。一個小時後，林陽模著額頭的汗水，看著坑坑窪窪岩壁，林陽確定沒遺留後，整個人跳回封印室里，讓老頭將封印室關閉後，領著眾人離開這個礦脈。
將老頭子送回商隊後，林陽才解除對老頭子的控制，領著雷霆小隊開始踏上返程。
「小戒，這次收獲的靈液，能轉換成多少能量點。」歸途中，林陽開始盤點收獲。
「預估為19兆能量點。」
「這麼多！？」林陽開心道。
「是啊，主人，要全部轉換成能量點嗎？」。小戒問道。
「嗯……先轉換1兆能量點，升級完我看看。」林陽思索片刻說道。
「好的，那我先轉換能量點，然後開始升級，升級時間需要一星期，這期間小戒將關閉所有功能，主人最好盡量避免以強者戰斗。」小戒說道。
「我知道了，你快點開始吧。」林陽對神戒的升級過程蠻好奇的。
指頭上的神戒散出瑩瑩光輝，林陽見狀想聯系神戒，發現神戒沒有任何回應，知道這應該就是神戒升級的過程。
……
一星期之後，神戒升級完畢，林陽從神戒那獲知，此次升級，神戒獲得了三項全新的功能，藥劑制造功能，武器冶煉功能，醫療系統功能，時空之力收集能力強化一倍，十年就可以搜集到穿越一個世界所使用的時空之力。
林陽這次身體的全面改造需要依靠醫療系統，醫療系統功能是治愈系統功能的升級版，原先治愈系統相當于小診所的話，那現在的醫療系統就相當于一家三甲醫院。
「主人，接下里可以進行全面基因改造，不過需要主人提供基因樣本。」神戒開口說道。
「需要多少細胞樣本？」林陽問道。
「抽取1克的骨髓樣本，消耗能量點進行基因培育，培育完後的基因跟主人的基因進行融合，達到基因改造的目的。」神戒出具一份具體數據，林陽見抽取的量不多才松了口氣，接著林陽開始思考要先融合哪種血繼，思來想去後，決定先從君麻呂的尸骨脈開始，防御高才是生存之道。
將君麻呂喚到自己的房間後，林陽吩咐道︰「君麻呂，等下將你背後的骨頭散開，留出一個空擋，我要抽取些你的骨髓樣本。」
「知道了，主人。」君麻呂應聲完，林陽見其背部的骨頭開始涌動，騰出一片空擋區，林陽按照神戒的指揮，將手按在君麻呂的背部，神戒刺出一根針扎入君麻呂的脊椎骨里，很快就抽取出樣本。
抽取完樣本後，林陽問道︰「君麻呂，有沒有什麼不適感？」
「沒有。」
「那就好，你出去吧。」
「是。」
君麻呂離開後，神戒開始培育基因細胞，很快神戒就培育好細胞了，林陽激動的接受基因改造。神戒綻放出整整綠芒將林陽包裹起來，形成一個光蛹。在光蛹內的林陽很快就意識模糊，陷入深層次的休眠狀態。