鳌拜党羽已经遍布朝廷内外，行动稍有不慎，必将打草惊蛇，酿成大变。孝庄帮助玄烨制定了擒贼先擒王的策略，迅速打击主要党羽，震慑其他成员。
于是玄烨挑选一批身强力壮的亲贵子弟，在宫内整日练习布库为戏。鳌拜见了，以为是皇帝年少，沉迷嬉乐，不仅不以为意，心中反暗自高兴。
康熙八年五月，康熙先将鳌拜的亲信派往各地，离开京城，又以自己的亲信掌握了京师的卫戍权。然后他召鳌拜入宫觐见。鳌拜此前常常出入宫廷，不以为奇。这次一召，他就毫无提防地来了。等到鳌拜入宫，康熙一声令下，少年们一拥而上，鳌拜猝不及防，被摔倒在地，束手就擒。
接着，康熙命议政王大臣等审讯鳌拜。大臣们审实后，宣布鳌拜三十条罪状，应处以革职、立斩。
鳌拜请求觐见康熙，让康熙看他为救康熙祖父皇太极而留下的伤疤。结果，累累伤痕和对上两代皇帝的功绩，终于使他保住了性命。康熙念及鳌拜资深年久，屡立战功，且无篡弑之迹，遂对他宽大处理，免死禁锢。其党羽也只处死最主要的数人，其余一律宽免。康熙八年，鳌拜在禁所死去。
遏必隆亦被康亲王杰书以十二项罪名弹劾，遂削去其太师之职，夺世爵，下狱论死。康熙九年，康熙帝念其为顾命大臣，而且是勋臣之子，命仍以公爵宿卫内廷。康熙十二年，遏必隆病重，康熙帝亲临府邸慰问，是年病逝。
鳖拜集团铲除后，孝庄放手让玄烨理政，让他在实践中得到锻炼，又一再提醒他要谨慎用人，安勿忘危，勤修武备等。对于祖母的教诲玄烨非常尊重，重大事情无不先一征求意见，然后施行。
努力改善满汉关系，祟儒重道，发挥汉族官员积极性，发展生产，恢复经济。在他们的携手努力下，清王朝从动乱走向稳定，经济从萧条走向繁荣，为平定三藩、统一台湾和边疆用兵等大规模战争奠定了物质基础。
对鳌拜集团的斗争过程中，孝庄玄烨祖孙相互加深了解，感情更为深厚。
而玄烨表现出他那一年龄少有的胆略和杰出组织才能，使孝庄满意而欣慰。玄烨也从祖母身上学到很多东西，缜密的思想方法，坚决果敢的作风。对他印象最深的，是祖母对人处事宽厚豁达的态度。正是在祖母的影响下，他处置鳌拜及其党羽时，运用宽严相济，打击面小，安抚、团结绝大多数朝臣的策略，收到人心安定、朝政稳固的效果。
孝庄的言传身教，使玄烨逐步具备了一代明君所应有的宽阔心胸与气度，这不仅在此次斗争中显示出来，在他其后的漫长统治岁月里，无论是平息党派之争，处理二废太子事件，或采取其它重要举措，这种方针策略依然被保留下来。足见孝庄的智慧品德与作风，已经体现在了孙儿身上，由他继承并发扬光大了。