除了政、經方面最重要的自然是軍事方面的重整。大會戰雖失利曹、孫仍具有相當的實力；為了不在逐鹿的行列中失序軍備的規劃自為必要。
回到許都後不久曹操立即下令各將領、謀臣分往各州招募青壯重新組建各大軍團並定於三年後整訓完畢。
先是虎豹騎五萬由典韋任軍團長曹純負責訓練；虎衛軍五萬軍團長是許褚李典負責訓練。
禁衛三軍分為六鎮每鎮八萬。分別是︰禁衛左軍又稱龍驤軍前鎮軍團長是夏侯惇；原雍涼軍為後鎮軍團由徐晃任主將。
禁衛中軍又稱飛熊軍前鎮軍團長曹仁後鎮軍團長曹洪。
禁衛左軍又稱虎賁軍前鎮軍團長夏侯淵後鎮軍團長曹真。
另成立精銳的許都皇城軍二萬由李典的族弟任執金吾。
這些是曹操的主力軍團無論裝備或戰力都屬最佳特點是由宗室或絕對效忠的將領出鎮。
接著是各州軍團。幽州方面在得知曹操戰敗的消息後公孫康乘機舉兵攻高句麗佔有樂浪等四郡自稱燕王又派信使往鮮卑、氐族通好收攏烏桓舊部還欲與劉備、孫策同盟圖謀割據一方進窺中原。曹操乃派三子曹彰率顏良、文丑重建幽州軍團十六萬分別是顏良的幽雲騎和文丑的燕雲騎包括原先曹彰舊部的黑甲軍打算穩定局面後再行征討。
冀州軍團八萬屬曹植的親衛軍由高覽任軍團長。
兗州為許都所在由曹操長子曹昂負責組建軍團又有「城衛軍」之稱。
並州軍團八萬由曹操的佷子曹安民任軍團長。
司州軍團八萬由鐘繇負責組建由曹休任軍團長。
豫州軍團八萬乃曹丕的親衛軍麾下有郭淮、牛金等將。
徐州軍團八萬又名神羽軍由樂進任軍團長。
青州軍團八萬由于禁任軍團長。
另重新組建玄武水軍八萬仍由換俘釋回的張允負責訓練地點選在微山湖。為此曹操特命徵集二十萬民夫將微山湖挖深加大使其規模接近洪澤湖；又連接能由淮河、沂水、泗水入海。
曹操的謀臣、武將都認為從曹操這樣的規劃看得出他仍然傾向讓曹昂、曹丕、曹植處於微妙的實力平衡狀態︰幽州、冀州的三個軍團屬於曹彰統領而曹彰支持曹植。兗州、並州、司州的三個軍團支持曹昂。豫州、徐州、青州的三個軍團都與曹丕關系密切。
只有郭嘉和受到郭嘉題醒的程昱心中明白曹操心中矚意的繼承人是誰。不過目前曹操身體狀況還不差所以也沒有人敢明目張膽的說些什麼。
江東方面孫策在眾謀臣武將的協助下也重新組建整策各大軍團。
直接由孫策指揮的有程普的絕天軍團韓當的裂地軍團；由周瑜直接指揮的是黃蓋的疾風軍團和丁奉的密雲軍團；負責保護吳郡由呂蒙指揮的驚雷軍團。由於會戰失利加上人口本就較少每軍團人數有四萬五年後希望能達到八萬。另有直接听命孫策的富春軍及會稽軍各二萬以及周瑜直接統屬的丹陽軍二萬。
直接巡弋鄱陽湖和太湖的兩支水軍分別是周泰指揮的暴雨軍團和蔣欽指揮的閃電軍團每軍團各八萬。
五大家的軍團指揮也由孫策親自任命分別是︰孫家的孫翊朱家的朱然張家的張昭之子張承顧家的顧雍之子顧劭全家的全柔之子全斌。軍團人數不一但也差不了多少多則六萬少則四萬。
此外還有徐宣、呂範、闞澤、諸葛謹、薛綜諸文臣董襲、凌統、潘璋等眾武將分領各郡政、軍事宜。
順帶一提的是喬家原是五大家之一；但在上一代家主喬槐過世前由於繼承紛擾最後喬玄在妹妹也是喬槐最疼愛的女兒喬絹的幫助下獲得家主地位。喬玄感激之余許諾與喬絹夫婦指月復為婚。後來喬絹的兒子就是6成。只是其他兄弟對此大感不滿紛紛與其他大家結盟以各種方式侵奪喬家利益削弱其地位。最後是與孫權關系密切的全氏家族崛起而喬家則在其他家的打壓下變成僅是保有財富的普通大商家而已。雖然如此孫權卻一心要娶喬煙為妻固然因為喬煙是「四美」之一也是因為喬家仍有為數不小的家業於是才引了連串事故。
許都丞相府議事廳。
這一日曹操率眾謀臣武將分別接見了來自劉、孫兩家的使者。劉備軍是簡雍簡憲和；江東是張紘張子綱。
簡雍表達了劉備和三大軍師十分務實的要求︰承認劉備皇叔身份兼領雍州牧其他如涼州、漢中等官員調派皆由劉備權宜。另有6羽私人請求希望能答應孫策所請讓孫權回到建業。
曹操臉色陰沉許久方道︰「既如此何不乾脆請封為王？」
簡雍從容道︰「天下未定我主公不敢作此非份之想。」
曹操怒道︰「若真讓他平定了天下恐怕不只封王裂土了。」
簡雍道︰「丞相固有文王之志我主公亦想上比周公。」
曹操定了定心情終於道︰「昔董卓勾結西羌禍亂京師。你主公若欲比周公之業先平西域再說。」於是答應劉備可權宜派任轄地官員只要求每年須向皇室納糧繳賦便打簡雍回覆。
接著曹操接見張紘。張紘具述得知劉備出示「血詔」周瑜只得听命攻打徐州非有意背盟請丞相見諒雲雲然後提出放孫權回去的要求條件是以曹真、張允交換江東軍退出徐州雙方以淮河為界。
曹操點頭道︰「血詔之事已證明是董承捏造孤已處理此事。目前仲謀為都城郎中令績效卓著孤決定請聖上下旨封他為左將軍授以平定山越事宜即日便可啟程到建業任職。你可告知吳侯。」
曹操此舉頗有用意。按郭嘉分析認為孫策愛弟心切極有可能親來迎接屆時便可布置一切。司馬懿和賈詡乘機進言為求萬一可下朝廷令旨；如此一來孫權行程必然遲慢。孫策為求愛弟早日歸回必會快馬親自來迎。
果然張紘消息傳到孫策喜不自勝不顧周瑜、張昭、魯肅等人勸阻執意親往迎接。另差使者到長安請6羽前來下聘擇日親來迎娶孫尚香。