「東京近郊的古泉市長出了巨大的植物！青葉你駕駛阿爾法號先行出發；飛鳥乘坐賽雷特巡邏車從地面趕赴目的地！你們兩個，這次不要再賭氣了！明白嗎？」。喜比隊長的聲音從通訊器中傳了出來。
「明白！」青葉應了一聲朝著阿爾法號走去。
「可是，隊長。為什麼不讓我駕駛阿爾法號？」飛鳥一臉郁悶的問道。
「笨蛋！」
喜比隊長看著屏幕中的飛鳥，大聲吼道︰「別給我嗦，趕緊出擊！不然，這回真開除了你！」
「啊~別啊隊長。咳咳~飛鳥現在，出發了！」飛鳥嘻笑著對喜比隊長說完沖已經坐上阿爾法號準備出發的青葉豎起中指，而青葉則同時伸出大拇指向上隨後逆時針旋轉90°猛的向下。
兩人都看到對方的挑釁動作，不服氣的哼了一聲。青葉駕駛的阿爾法號正往起飛軌道上而去；飛鳥則快步跑向停放賽雷特巡邏車的車庫……
當駕駛著阿爾法號朝著古泉市方向全速進發的青葉抵達古泉市範圍內的時候，透過機窗單憑肉眼都已經能夠看到喜比隊長所說的巨大植物，也就是幾乎覆蓋整個古泉市的巨型蘑菇狀物質。
「哇~好大啊！不過這是什麼？」駕駛著阿爾法號沿著巨型蘑菇狀物體飛行的青葉透過機窗看著那布滿五顏六色色澤的表面一陣驚嘆，隨後不知道眼前這巨型蘑菇狀體是什麼的青葉又喃喃自語道。
外太空的宇宙空間中，一艘移動基地正漂浮在地球上空，這個移動基地正是作為TPC所推進新領域時代計劃而開發的象征－－庫拉克呼NF－3000。
庫拉科夫移動基地是能夠以宇宙空間為主，前往怪獸出現現場上空，發揮出作為Super－GUTS前線基地作用的移動基地，現在正由幸田隊員進行負責指揮。
「到目前為止，還沒有動態反應。」通過移動到古泉市上空的移動基地分析的情報，其中一位TPC工作人員對著現在移動基地負責人幸田報告道。
「青葉，去采集一些樣本回來！」听完工作人員的報告，幸田接通阿爾法號的通訊對著青葉下達最新指令，並且還特意囑咐道︰「雖然那弗加斯好像很好吃的樣子，但是不要吃哦~」
「弗加斯？」听到幸田特意囑咐地所謂「弗加斯」，青葉疑惑地道出自己的不解。
「就是英文里毒蘑菇的意思，那家伙的代號。」見青葉並不知道「弗加斯」是指什麼東西，幸田當即嚴肅地對著青葉解答道。
「明白！」
「幸田隊員，那麼我呢？」使用最快速度趕到現場附近的飛鳥通過無線電向幸田詢問道，不過這回飛鳥學乖了將賽雷特巡邏車的速度控制在規定的極限速度。
「你就負責查看下四周還有沒有沒有撤離的市民吧！」
「啊~好吧……」
原本還想抱怨的飛鳥見到幸田一臉嚴肅的表情，只得認命。
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Super－GUTS指揮室中，眾人也正在觀看著大屏幕內由移動基地傳送過來的巨型弗加斯的影像。
「青葉，別因為它是植物就大意。」看著屏幕中那顏色鮮艷多色的弗加斯表面，狩矢出聲提醒青葉道，而站于一旁的喜比隊長也點頭贊同狩矢的觀點。
「我說狩矢啊，蘑菇這種東西是沒有葉綠素的，所以說它不是植物！那是菌類的孢子。」听到狩矢將蘑菇歸類為植物，中島馬上對著狩矢反駁道，而喜比隊長在一旁又是似懂非懂的點頭贊同。
「孢子？」良好奇地出聲問道。
「沒錯，現在在生物界中，既不屬于動物也不屬于植物，而歸于第三生命體的也有很多。」听到良的發問，中島立刻像是打開了話匣子似得滔滔不絕地將自己所指的知識道出，「其實呢，本體也就是土里的菌絲，蘑菇的實體就是果實，是為了傳播孢子的器官罷了。」
「好久沒有是松茸了啊……」不耐煩地听完中島那喋喋不休的知識言論，狩矢懶散地倚在指揮室內的護欄忽發奇想般感嘆道。
「反正也吃不起，工資就那麼一點點~」
狩矢話音剛落，麻衣恰到好處地現身吐槽道，而狩矢、中島還有良也是一副深有同感般點頭附和綠川麻衣的話。而尷尬不已地喜比隊長此時也只能輕咳幾聲裝作沒有听到……
另一方面
由于受到身處移動基地內的幸田的指示，青葉當即駕駛著阿爾法號降落到巨型弗加斯不遠處，然後走出阿爾法號準備前往弗加斯內部采集樣本以供研究。
手持布萊克機關槍的青葉走出阿爾法號，然後向著位于眼前不遠處的巨型蘑菇弗加斯走去。等到青葉走進弗加斯覆蓋範圍後才驚訝的發現，古泉市被弗加斯所覆蓋的程度遠超青葉想象。到處都是弗加斯蔓延而出的大量菌絲，有的破土而出隨意地覆蓋到地面，有的則是直接纏繞在柱狀建築上，放眼望去到處都有被菌絲所覆蓋的痕跡。
青葉手持布萊克機關槍小心謹慎地游走在被菌絲佔領的古泉市內，隨時準備好應付可能出現的襲擊。
「這是什麼？」游走于古泉市內的青葉看著布滿整個城市的菌絲，不明所以地對著頭盔內的通訊器發問的同時還好奇地想伸手去觸踫距離自己最近的菌絲。
「千萬不要踫它！」
在青葉手還沒有觸踫到菌絲的時候，中島的喝聲忽然從通訊器內傳出，及時制止了青葉這一莽撞行為。
「如果是蘑菇的話。你踫到它的菌絲，就會長出菇來的！」Super－GUTS指揮室內的中島對著好奇的青葉解釋著不能觸踫菌絲的原因。
「唉？！」
指揮室屏幕中的青葉聞言也是心有余悸地看了看自己的手，慶幸自己還好沒踫到菌絲。
而就在這時，Super－GUTS指揮室內的屏幕影像忽然一陣不穩定，隨後直接轉變為雪花點，而與身處「弗加斯」內部的青葉的通信也被莫名中斷！
「怎麼回事？」
看著一陣雪花點的屏幕，喜比隊長看向負責這方面的通訊員綠川麻衣出聲詢問道，畢竟這種情況下讓性格沖動的青葉單獨行動可不是什麼好事，而且另一個更加魯莽的飛鳥剛剛進入了「弗加斯」內部。
喜比隊長發問的聲音方落，原本布滿雪花點的屏幕沒有絲毫預兆地一暗，緊接著被密密麻麻地字體所覆蓋，最終正如同先前大樓遭遇的情況一樣，只剩下顯示著「再見，人類」的字樣。
「麻衣，把古泉市的錄像畫面調出來。」屏幕內顯示的字樣喜比隊長並不知道是什麼情況，于是回頭看向這方面的能手綠川麻衣說道。
「不行，電腦被入侵了！」
綠川麻衣拼命敲擊著鍵盤，但隨後回頭回答了喜比隊長的話，接著看向自己身前電腦屏幕所顯示的狀況，神情著急地再次回頭看向喜比隊長說道，「所有對外聯絡都被完全切斷了！」
「好吧……」听到綠川麻衣的回答，喜比隊長明白現在Super－GUTS所面臨的緊急情況，當下立刻做出了緊急作戰部署，「中島和狩矢駕駛貝塔號，良駕駛伽馬號前往現場！但是，總部現在無法提供任何的援助！小心一點……」
「明白！」
中島、狩矢以及良三人立刻端正站姿，隨後堅定地對著喜比隊長比出大拇指回答道。然後迅速按照喜比隊長的作戰部署，各自駕駛著貝塔號以及伽馬號朝著古泉市火速進發。
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由于失去與總部的聯絡，所以青葉和飛鳥現在只能自由行動。
就在青葉小心翼翼地探索著被菌絲佔領的古泉市情況的時候，突然感覺到了在那片被菌絲層層包裹的一處地方好像正在不斷向外散發出某種類似能量的波動。
「是那里嗎？」。
青葉望著那密密麻麻的菌絲，毫無畏懼的向前走去……
與此同時，正在尋找青葉身影的飛鳥，卻忽然發覺自己身後似乎有什麼動靜。
「你，這里很危險，快去避難吧！」等到飛鳥轉身後卻只看到一道人影迅速躲到柱子後面，以為是古泉市幸存者的飛鳥立刻對著那「人」叫道。
不過對于飛鳥好心的提醒，那人影似乎並不領情，繼續躲在柱子後方絲毫沒有現身的打算。飛鳥見狀疑惑地就想要上前去勸說，但就在飛鳥走到那個柱子處因為沒有發現人影而疑惑的瞬間，一團菌絲浮現在飛鳥身後，快速凝聚成為一長相怪異的類人型生物。
長相怪異的類人型生物剛凝聚成型便立刻將自己的右臂化作菌絲觸手，趁著飛鳥分神間快速從飛鳥身後反勒住他的脖子，毫無防備的飛鳥被菌絲觸手勒住後還沒有來得及掙扎就感到一陣窒息感傳至大腦，還沒能夠轉身看到偷襲自己的家伙的模樣便已昏迷倒地，最後被神秘出現的類人型生物帶走…….